Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Foxd4Q60688 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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