Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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