Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms