Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc3lQ4KL14 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms