Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxn3Q499D0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms