Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms