Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms