Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm648Q3UJ22 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm648Q3UJ22 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm648Q3UJ22 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm648Q3UJ22 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm648Q3UJ22 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms