Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms