Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc174Q3U155 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms