Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cwc27Q3TKY6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms