Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rhox4dQ2MDG0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms