Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms