Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
StumQ0VBF8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
StumQ0VBF8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms