Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms