Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms