Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cab39Q06138 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms