Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms