Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited1P97769 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms