Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms