Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SmsP97355 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SmsP97355 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SmsP97355 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SmsP97355 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SmsP97355 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SmsP97355 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SmsP97355 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SmsP97355 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms