Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NficP70255 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NficP70255 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NficP70255 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms