Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacnb3P54285 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms