Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PctpP53808 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PctpP53808 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PctpP53808 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PctpP53808 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PctpP53808 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms