Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k1P53349 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k1P53349 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k1P53349 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k1P53349 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms