Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnfP51944 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms