Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms