Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms