Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms