Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms