Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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LtbP41155 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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LtbP41155 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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LtbP41155 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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LtbP41155 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LtbP41155 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtbP41155 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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LtbP41155 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtbP41155 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtbP41155 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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LtbP41155 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LtbP41155 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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LtbP41155 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LtbP41155 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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