Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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