Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms