Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa5P28312 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms