Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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