Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms