Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ndufb1P0DN34 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms