Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn4O70507 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn4O70507 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms