Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stra6O70491 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stra6O70491 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms