Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdkO55028 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms