Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlkO54988 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SlkO54988 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SlkO54988 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms