Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms