Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smad6O35182 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Smad6O35182 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smad6O35182 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms