Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ArxO35085 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ArxO35085 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ArxO35085 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms