Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms