Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm5294J3QP53 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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