Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms