Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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