Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arid4aF8VPQ2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms