Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms